Департамент управління справами та регіонального розвитку

1. Відділ забезпечення діяльності Голови ДМС
2. Відділ організацій діяльності територіальних органів та звітності
3. Відділ документального забезпечення
4. Відділ аналітично-методичного забезпечення
5. Відділ моніторингу реалізації стратегічних заходів та контролю

Департамент юридичного забезпечення

1. Відділ нормативно-правових актів та їх супроводження
2. Відділ юридичного забезпечення фінансово-господарської діяльності
3. Відділ судово-претензійної роботи
4. Відділ організації роботи зі зверненнями громадян та організації доступу до публічної інформації

Управління персоналу

1. Відділ кадрового забезпечення та професійної підготовки
2. Відділ проходження державної служби

Департамент у справах біженців та іноземців

1. Відділ по роботі з біженцями та іншими категоріями мігрантів
2. Відділ організації роботи пунктів утримання біженців та інших категорій мігрантів
3. Відділ соціальної інтеграції та супроводу
4. Відділ взаємодії з неурядовими гуманітарними організаціями
5. Відділ тимчасового перебування, обліку іноземців та ОБГ
6. Відділ індентифікації іноземців та добровільного повернення
7. Відідл імміграційної роботи

Департамент паспортної роботи та громадянства

1. Відділ паспортної роботи
2. Відділ реєстрації фізичних осіб та взаємодії з органами ведення Державного реєстру виборців та ДПСУ
3. Відділ еміграції та оформлення документів для виїзду за кордон
4. Відділ громадянства

Департамент бухгалтерської служби та ресурсного забезпечення

1. Відділ бухгалтерської служби
2. Відділ фінансово-економічного забезпечення
3. Відділ ресурсного забезпечення
4. Господарський відділ

Департамент інформаційних технологій

1. Відділ інформатизації та нормативного забезпечення
2. Відділ інформаційно-телекомунікаційних систем та технічного забезпечення 
3. Відділ експлуатації програмно-технічних комплексів ДІС та обробки інформації
4. Відділ захисту інформації